In quest’anno il rettore Girolamo Pannilini aveva rivolto al Comune di Siena una petizione per ottenere in appalto un campo di circa mezzo staio “situato fuori della porta San Marco per farvi costruire un nuovo camposanto e liberare la fabbrica dello Spedale (…) non tanto dalle cattive esalazioni che venivano a diffondersi per tutta la detta fabbrica con danno dei malati, e dei serventi, quanto ancora per poter riparare al patimento che recano alla detta fabbrica le sepolture del vecchio Campo Santo”.
Al Santa Maria della Scala viene concesso il campetto detto “orto del Terrarzi”, tenuto in affitto dal medesimo, e proprio su questo terreno venne costruito il nuovo cimitero.
Tra le migliorie apportate da Pannilini ci fu l’introduzione dell’insegnamento pratico della medicina e chirurgia, portando nelle sale dell’ospedale gli studenti dell’Università.
Un anno prima di morire nomina il figlio Giulio suo coadiuvante che sarà, poi, Rettore dopo di lui.